Трофимов пришел в Союзмультфильм в 1970-е годы. Самыми известными работами, в создании которых он участвовал, стали кукольные мультфильмы «Приключения незнайки и его друзей» по одноименной повести Николая Носова, «Волшебник изумрудного города» по Александру Волкову и «Черная курица» по Антону Погорельскому.
С 2000-х годов Трофимов в качестве художника-постановщика работает в российских телесериалах.
